熱管換熱器的結構在進行使用的過程中會有別于其他形式的換熱器，整個設備的傳熱效率高且結構緊湊，熱管換熱器的換熱流體的阻力損失小且外形變化靈活，在使用時其環境適應性強。

熱管換熱器可以有效的通過其換熱器的中隔板使得冷熱流體完全分開，在運行的過程中單根熱管會因為其磨損、腐蝕、超溫等原因發生破壞時基本不影響換熱器運行。

熱管換熱器在運行時易燃、易爆、腐蝕性強的流體換熱場合具有很高的可靠性熱流體完全分開流動，可以比較容易的實現冷、熱流體的逆流換熱。冷熱流體均在管外流動，由于管外流動的換熱系數遠高于管內流動的換熱系數，用于品位較低的熱能回收場合非常經濟。

熱管換熱器對于其含塵量較高的流體，其設備可以通過其結構的變化，擴展受熱面等形式解決換熱器的磨損和堵灰問題，設備用于帶有腐蝕性的煙氣余熱回收時，可以通過調整蒸發段、冷凝段的傳熱面積來調整熱管管壁溫度，使熱管盡可能避開的腐蝕區域。

分離式熱管換熱器在進行使用時是一種獨特的結構形式，這樣的設備在進行布置的過程中非常的靈活且變化隨意，設備可以實現遠距離熱量交換，可以實現一種流體和幾種流體同時換熱。

分離式熱管換熱器可以完全隔絕兩種或多種換熱流體。分離式熱管的加熱段和冷凝段分別置于兩個獨立的換熱流體通道中，熱管內部的工作液體在加熱段吸熱蒸發后通過蒸汽，上升管輸送熱量到冷凝段，放熱冷凝后通過冷凝液下降管回流到加熱段。